牙齿错牙合畸形的原因有很多，大体可以归纳为两类：遗传因素和环境因素。根据临床统计，错牙合畸形的病因中遗传因素占２９％，环境因素占７１％。在环境因素中后天的因素又起着很大的作用，其中咀嚼功能退化是主要原因之一。
在人类进化过程中，食物由生到熟、由粗到细、由硬到软，咀嚼器官的功能日益减弱，而咀嚼器官退化、减少出现不平衡现象，即肌肉居先，颌骨次之，牙齿再次之，颌骨减少而牙齿的数量没有减少，因而颌骨容纳不下所有的牙齿，导致出现牙齿拥挤等畸形。现在儿童的食品越来越精细，比如大量的奶制品、面包、膨化食品，致使孩子的咀嚼功能越来越弱，同时，孩子也越来越懒得咀嚼硬东西，这使得孩子的牙齿和口腔内外的肌肉得不到应有的锻炼，导致肌肉无力、萎缩，进而颌骨也不能很好地发育，而牙齿的数量没有减少，所以现在儿童牙齿错牙合畸形的发病率越来越多了。另一方面，精细的食物还容易引起牙齿龋坏，造成牙齿缺损，致使乳牙过早丢失，引起恒牙萌出的间隙不足，进而造成牙齿排列不齐。
